La représentation au sein des structures de coordination se décide au sein des Groupes de Travails concernés. Par exemple des ONGI représentants le FONGIM au sein des structures de coordination humanitaires sont élues par le Groupe de Travail Humanitaire. Les ONGI représentent ainsi le GTH-FONGIM au sein des réunions mensuelles de l'Equipe Humanitaire Pays (EHP), des CMCoord stratégiques & décisionnelles, du Groupe de Travail Accès (GTA), des réunions GTH-OCHA etc. Les représentants consultent les membres et les informent sur le contenu des discussions externes.